ট্রান্সলেশন (জীববিজ্ঞান)

mRNA থেকে প্রোটিন তৈরির প্রক্রিয়া

জীববিজ্ঞানে, ট্রান্সলেশন হচ্ছে RNA অণুকে ছাঁচরূপে ব্যাবহার করে জীবিত কোষে পলিপেপটাইড বা প্রোটিন তৈরির প্রক্রিয়া।প্রোটিন মূলত অ্যামিনো এসিডের শৃঙ্খল যা আরএনএ তে নিউক্লিওটাইড এর বিন্যাস অনুসারে তৈরি হয় ।এটি কোষের সাইটোপ্লাজমে ঘটে।

প্রকৃতকোষে messenger RNA (mRNA) ট্রান্সলেশন পদ্ধতি
mRNA ট্রান্সলেশন এবং রাইবোজোমাল প্রোটিন সংশ্লেষণ
ট্রান্সলেশনের সূচনা এবং বৃদ্ধিকরণ পর্ব,RNA নিউক্লিয়েজ,রাইবোজোম,trasfer RNA(tRNA),এবং অ্যমিনো এসিড সহ
ট্রান্সলেশনের তিনটি পর্যায়: (১) সূচনা পর্ব; (২)বৃদ্ধিকরণ পর্ব, যেটা বড় সাবইউনিটটি সংযুক্ত হওয়ার সাথে সাথে শুরু হয়; (৩)সমাপ্তিকরণ পর্ব,স্টপ কোডন রাইবোজোমের কাছে পৌঁছে এবং পলিপেপটাইড মুক্ত হয়

তিনটি পর্যায়ে ট্রান্সলেশন প্রক্রিয়াটি সংঘটিত হয়:

  1. সূচনা পর্ব:রাইবোজোমগুলো টার্গেট mRNA এর চারিদিকে জড়ো হয় এবং প্রথম tRNA স্টার্ট কোডনে সংযুক্ত হয়।
  2. বৃদ্ধিকরণ পর্ব:প্রতিটি tRNA কে ছোট রাইবোসোমাল সাব-ইউনিটগুলো শনাক্ত করে(accommodation)এবং কোডের নির্দেশ অনুযায়ী অ্যামিনো অ্যাসিড সরবরাহ করে। এটি বড় রাইবোসোমাল সাবইউনিটে বাহিত হয় এবং এর পূর্ববর্তী শনাক্তকৃত tRNA'র সাথে বণ্ড(বন্ধন) তৈরি করে(transpeptidation)।রাইবোসোম প্রক্রিয়াটি চালিয়ে যাওয়ার জন্য পরবর্তী mRNA কোডনে যায়(translocation)। এভাবে একটি অ্যামিনো অ্যাসিড শৃঙ্খল তৈরি হয়।
  3. সমাপ্তিকরণ পর্ব: স্টপ কোডন পৌঁছানোর সঙ্গে সঙ্গে রাইবোসোম থেকে পলিপেপটাইডটি বিমুক্ত হয়। রাইবোসোমাল কমপ্লেক্সটি(যৌগ) অক্ষত থাকে এবং পরবর্তী mRNA ট্রান্সলেশনের জন্য চলে যায়।

প্রোক্যারিওটায় (প্রাককেন্দ্রিক কোষে) (ব্যাকটেরিয়া এবং আর্কিয়া),ট্রান্সলেশন সাইটোপ্লাজমীয় মাতৃকা বা সাইটোসলে ঘটে, যেখানে রাইবোসোমের বড় এবং ছোট সাবইউনিটগুলি mRNA এর সাথে আবদ্ধ হয়। ইউক্যারিওটায় (প্রকৃতকোষে),ট্রান্সলেশন সাইটোপ্লাজম বা এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলামের(অন্তঃপ্লাজমীয় জালিকা) ঝিল্লি জুড়ে কো-ট্রান্সলেশনাল ট্রান্সলোকেশন নামক একটি প্রক্রিয়ায় ঘটে।

মৌল প্রক্রিয়া

সম্পাদনা
 
রাইবোজোম এন্ডোপ্লাজমিক রেটিকুলামে নিঃসৃত একটি প্রোটিন ট্রান্সলেট করছে (tRNA গাঢ় নীল রঙে রঞ্জিত)
 
tRNA'র ত্রিমাত্রিক গঠন (CCA tail হলুদ রঙে রঞ্জিত, Acceptor stem বেগুনি রঙে রঞ্জিত, Variable loop কমলা রঙে রঞ্জিত, D বাহু লাল রঙে রঞ্জিত, Anticodon বাহু নীল রঙে এবং Anticodon কালো রঙে রঞ্জিত, T বাহু সবুজ রঙে রঞ্জিত)

ট্রান্সলেশনের গাণিতিক মডেল

সম্পাদনা
 
চিত্র M0:প্রোটিন সংশ্লেষণের সবচেয়ে মৌলিক ও সরল মডেল M0। এখানে , M – সূচনা পর্বে Assembling Ribosome কর্তৃক অনধিকৃত mRNA'র পরিমাণ, F – সূচনা পর্বে Assembling Ribosome কর্তৃক অধিকৃত mRNA'র পরিমাণ, R – রাইবোজোমের উপর বসে থাকা প্রোটিন সংশ্লেষকারী mRNA'র পরিমান, F – সংশ্লেষিত প্রোটিনের পরিমাণ।
 
চিত্র M1:প্রোটিন সংশ্লেষণের বর্ধিত মডেল M1, যেখানে স্পষ্টভাবে 40S, 60S এবং Initiation factors(IF) এর বন্ধন দেখা যাচ্ছে।

ট্রান্সক্রিপশনট্রান্সলেশন প্রক্রিয়ার বর্ণনা (শুধুমাত্র মৌলিক এবং প্রাথমিক ধাপসমূহ) :

  1. mRNA অণু সৃষ্টি (স্প্লাইসিং সহ),
  2. Initiation factor এর সাহায্যে সূচনা পর্বের আরম্ভ (বিঃদ্রঃ সূচনা পর্বে Circularization ধাপ থাকতে পারে যদিও সবক্ষেত্রে প্রযোজ্য নয়),
  3. ট্রান্সলেশনের সূচনা,ছোট রাইবোসোমাল সাবইউনিট যুক্ত হওয়া ,
  4. সম্পূর্ণ রাইবোজোম একত্রিত হওয়া,
  5. বর্ধিতকরণ , (অর্থাৎ, প্রোটিন তৈরি করার সাথে সাথে রাইবোজোমের mRNA'র প্রান্তের দিকে অগ্রসর হওয়া),
  6. ট্রান্সলেশনের সমাপ্তি,,
  7. mRNA অণুর অবমুক্তি,
  8. প্রোটিনের অবমুক্তি।

জেনেটিক কোড

সম্পাদনা

নিজহাতে (স্বল্প পরিসরে) বা কম্পিউটারে (প্রথমে সঠিকভাবে প্রোগ্রাম করার পর, নিম্নে দেখুন) ট্রান্সলেশন করা সম্ভব ; এভাবে জীববিজ্ঞানীরা কিংবা রসায়নবিদেরা কাগজের উপর এনকোডেড প্রোটিনের গঠন এঁকে থাকেন। প্রথমে প্রত্যেকটি DNA ছাঁচকে এর সম্পূরক RNA (উল্লেখ্য, RNA এর ক্ষেত্রে A এর সম্পূরক U) দ্বারা পরিবর্তন করতে হবে ,যেমনটা নিম্নে দেখানো হয়েছে। এখনে উল্লেখ্য যে DNA'র ছাঁচ সূত্রক হবে সেইটা যার সাথে RNA যুক্ত হতে পারে(অর্থাৎ অনুবন্ধী সূত্রক) এবং অন্য DNA সূত্রকটি RNA'র সমরূপ হবে, কিন্তু থায়ামিনের(T) পরিবর্তে ইউরাসিল(U) হবে।

DNA -> RNA
 A  ->  U
 T  ->  A
 C  ->  G
 G  ->  C
 A=T-> A=U 

তারপর RNA কে ট্রিপলেটে(তিনটি ক্ষারের একেকটা গ্রুপ) বিভক্ত করতে হয়। মনে রাখতে হবে যে এখানে তিনটি Reading Frame (তিন জায়গা থেকে হিসাব শুরু করার সুযোগ) আছে,যা কোডটি কোথা থেকে পড়া হচ্ছে তার উপর নির্ভরশীল। সবশেষে রসায়নশাস্ত্রে ব্যাবহৃত জেনেটিক কোডের টেবিলটি অনুসরণ করে কোডটি গাঠনিক সংকেতে রূপান্তরিত করতে হবে।

এভাবে প্রোটিনের একটি প্রাথমিক গঠন পাওয়া যাবে।

উদাহরণ: স্ট্যান্ডার্ড জেনেটিক কোডের জন্য সংক্ষিপ্ত ট্রান্সলেশন টেবিল (NCBI এর ট্যাক্সোনমি ওয়েবপেজ থেকে)।[]

 AAs    = FFLLSSSSYY**CC*WLLLLPPPPHHQQRRRRIIIMTTTTNNKKSSRRVVVVAAAADDEEGGGG
 Starts = ---M---------------M---------------M----------------------------
 Base1  = TTTTTTTTTTTTTTTTCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGGGGGGGGGGGGGG
 Base2  = TTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGGTTTTCCCCAAAAGGGG
 Base3  = TCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAGTCAG

"Starts" সারিটি তিনটি স্টার্ট কোডন UUG, CUG এবং উভয়েরই সাধারণ ক্ষার AUG নির্দেশ করে।আবার যদি এখান থেকে ট্রান্সলেশনের সূচনা বিবেচনা করা হয় তাহলে এটি প্রথম সংশ্লেষিত অ্যামিনো অ্যাসিডের অবশিষ্টাংশ নির্দেশ করে এবং সেক্ষেত্রে এটি AUG অর্থাৎ মেথিওনিন হবে।

ট্রান্সলেশন টেবিল

সম্পাদনা

এমনকি ঈস্টের মত একটি সাধারণ প্রকৃতকোষের জিনোম সিকোয়েন্সের জন্যেও বিকল্প ট্রান্সলেশন টেবিল ব্যাবহার করার প্রয়োজন হয়ে থাকে-যাকে ট্রান্সলেশন অব মাইটোকন্ড্রিয়াল জিন্স বলা হয়। বর্তমানে নিম্নবর্ণিত ট্রান্সলেশন টেবিলগুলো NCBI Taxonomy Group for the translation of sequences in GenBank কর্তৃক নির্ধারিত হয়ে থাকে:[]

  1. স্ট্যান্ডার্ড কোড
  2. ভার্টিব্রেট মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  3. ঈস্ট মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  4. মোল্ড,প্রোটোজোয়া অ্যান্ড সিলোমেট মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড অ্যান্ড মাইকোপ্লাজমা/স্পাইরোপ্লাজমা কোড
  5. ইনভার্টিব্রেট মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  6. সিলিয়েট,ড্যাসাইক্লাডেসিন অ্যান্ড হেক্সামিটা নিউক্লিয়ার কোড
  7. কাইনেটোপ্লাস্ট কোড
  8. একাইনোডার্ম অ্যান্ড ফ্লাটওয়ার্ম মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  9. ইউপ্লোটিড নিউক্লিয়ার কোড
  10. ব্যাকটেরিয়াল,আরকিয়াল,অ্যান্ড প্লান্ট প্লাস্টিড কোড
  11. বিকল্প ঈস্ট নিউক্লিয়ার কোড
  12. অ্যাসিডিয়ান মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  13. বিকল্প ফ্লাটওয়ার্ম মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  14. ব্লেফারিসমা নিউক্লিয়ার কোড
  15. ক্লোরোফাইসিয়ান মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  16. ট্রেমাটোড মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  17. Scenedesmus obliquus মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  18. থ্রস্টোকাইট্রিয়াম মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  19. টেরোব্রাঙ্কিয়া মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড
  20. ক্যান্ডিডেট ডিভিশন SR1 অ্যান্ড গ্রাসিলিব্যাক্টেরিয়া কোড
  21. Pachysolen tannophilus নিউক্লিয়ার কোড
  22. ক্যারিওরেলিক্ট নিউক্লিয়ার কোড
  23. কন্ডাইলোস্টোমা নিউক্লিয়ার কোড
  24. মেসোডিনিয়াম নিউক্লিয়ার কোড
  25. পেরিট্রাইক নিউক্লিয়ার কোড
  26. ব্লাস্টোক্রিথিডায়া নিউক্লিয়ার কোড
  27. সেফালোডিসিডাই মাইটোকন্ড্রিয়াল কোড

আরও দেখুন

সম্পাদনা

উদ্ধৃতিসমূহ

সম্পাদনা
  1. Elzanowski, Andrzej; Ostell, Jim (জানুয়ারি ২০১৯)। "The Genetic Codes"National Center for Biotechnology Information (NCBI)। সংগ্রহের তারিখ ৩১ মে ২০২২ 

আরও পড়ুন

সম্পাদনা
  • Champe, Pamela C; Harvey, Richard A; Ferrier, Denise R (২০০৪)। Lippincott's Illustrated Reviews: Biochemistry (3rd সংস্করণ)। Hagerstwon, MD: Lippincott Williams & Wilkins। আইএসবিএন 0-7817-2265-9 
  • Cox, Michael; Nelson, David R.; Lehninger, Albert L (২০০৫)। Lehninger principles of biochemistry (4th সংস্করণ)। San Francisco...: W.H. Freeman। আইএসবিএন 0-7167-4339-6 
  • Malys N, McCarthy JE (মার্চ ২০১১)। "Translation initiation: variations in the mechanism can be anticipated"। Cellular and Molecular Life Sciences68 (6): 991–1003। এসটুসিআইডি 31720000ডিওআই:10.1007/s00018-010-0588-zপিএমআইডি 21076851 

বহিঃসংযোগ

সম্পাদনা