দিপক মাহাতো ১৬ ই ডিেসম্বর ১৯৭৯ সালে সিরাজগঞ্জ জেলাধীন তাড়াশ থানার নওগাঁ ইউনিয়নের অন্তর্গত চলনবিলের এক প্রত্যান্ত গ্রামে (পংরৌহালী) জন্মগ্রহন করেন। পিতার নাম কানাই লাল মাহাতো এবং মাতার নাম সুখমনি দাস্যা। চার ভাই-বোনের মধ্যে দিপক মাহাতো তৃতীয় সন্তান এবং একমাত্র বোন সবার ছোট। দিপক মাহাতো লেখা-পড়ার হাতে খড়ি হয় নওগাঁ সরকারী প্রাথমিক বিদ্যালয়ে। এরপর মাটিয়া মালিপাড়া হাই স্কুল ও সিরাজগঞ্জ সরকারী কলেজ থেকে কৃতিত্ত্বের সঙ্গে মাধ্যমিক ও উচ্চ মাধ্যমিক পাশ করেন। এরপর বাংলাদেশ কৃষি বিশ্ববিদ্যালয় থেকে ২০০৩ সালে বিএসসি ইন এগ্রিকালচারাল ইকনোমিক্স এবং ২০০৫ সালে এমএস ইন কৃষি বিপনন ডিগ্রি লাভ করেন। বর্তমানে তিনি বাংলাদেশ কৃষি গবেষণা কাউন্সিলে প্রকল্প বাস্তবায়ন বিভাগে মনিটরিং এসোসিয়েট হিসেবে কর্মরত আছেন। সেইসাথে বাংলাদেশ কৃষি বিশ্ববিদ্যালয়ের গ্রামীণ সমাজ বিজ্ঞান বিভাগের আওতায় পিএইচডি গবেষণা কর্মে নিযুক্ত আছেন।