হেমাডিন(Haemadin) হল একটি অ্যান্টিকোয়াগুল্যান্ট পেপটাইড ভারতীয় জোঁক, হেমাডিপসা সিলভেস্ট্রিস দ্বারা সংশ্লেষিত। এটি পাঁচটি সংক্ষিপ্ত বিটা-স্ট্র্যান্ড (বিটা ১-বিটা ৫) নিয়ে গঠিত একটি সেকেন্ডারি স্ট্রাকচার গ্রহণ করে, যা দুটি এন্টিপ্যারালাল বিকৃত শীট একে অপরের মুখোমুখি বিটা ১-বিটা ৪-বিটা ৫ এবং বিটা ২-বিটা ৩ দ্বারা গঠিত। এই বিটা-স্যান্ডউইচ একটি [১-২, ৩-৫, ৪-৬] ডাইসালফাইড জোড়ায় সাজানো ছয়টি ঘেরা সিস্টাইন দ্বারা স্থিতিশীল হয় যার ফলে একটি ডিসালফাইড সমৃদ্ধ হয় হাইড্রোফোবিক কোর যা মূলত বাল্ক দ্রাবক-এর কাছে অপ্রাপ্য। ডাইসালফাইড বন্ড [৩-৫] এবং [৪-৬] এর কাছাকাছি অবস্থান হেমাডিনকে চারটি স্বতন্ত্র লুপ-এ সংগঠিত করে। এই ডোমেন-এর এন-টার্মিনাল সেগমেন্ট থ্রম্বিন-এর সক্রিয় সাইট সাথে আবদ্ধ হয়, এটিকে বাধা দেয়।[১]

একটি অ্যান্টিকোয়াগুল্যান্ট বৈশিষ্ট্যসম্পন্ন হেমাডিনের ত্রিমাত্রিক চিত্র

হেমাডিন (এমইআরওপিএস আই১৪.০০২) একটি সুপারফ্যামিলি (এমইআরওপিএস আইএম) প্রোটিজ ইনহিবিটরস এর অন্তর্গত যার মধ্যে হিরুডিন (এমইআরওপিএস আই১৪.০০১) এবং অ্যান্টিস্ট্যাসিন (এমইআরওপিএস আই১৫) অন্তর্ভুক্ত রয়েছে।[২][৩]

তথ্যসূত্র সম্পাদনা

  1. Richardson JL, Kroger B, Hoeffken W, Sadler JE, Pereira P, Huber R, Bode W, Fuentes-Prior P (নভেম্বর ২০০০)। "Crystal structure of the human alpha-thrombin-haemadin complex: an exosite II-binding inhibitor"EMBO J.19 (21): 5650–60। ডিওআই:10.1093/emboj/19.21.5650পিএমআইডি 11060016পিএমসি 305786  
  2. "InterPro"www.ebi.ac.uk 
  3. "Clan IM"MEROPS - the Peptidase Database 

টেমপ্লেট:ইন্টারপ্রো সামগ্রী