যুদ্ধের পর খালেদ মোশাররফ [[ঢাকা]] সেনা সদর দপ্তরে স্টাফ অফিসার হিসেবে নিয়োগ লাভ করেন। পরে তিনি [[বাংলাদেশ]] সেনাবাহিনীর চীফচিফ অব জেনারেল স্টাফ (সিজিএস) হিসেবে নিয়োগ লাভ করেন। মুক্তিযুদ্ধে বীরত্বপূর্ণ ভূমিকা পালনের জন্য বাংলাদেশ সরকার ১৯৭২ সালে খালেদ মোশাররফকে '''[[বীর উত্তম]]''' উপাধিতে ভূষিত করে। বঙ্গবন্ধু [[শেখ মুজিবুর রহমান|শেখ মুজিবুর রহমানের]] সপরিবারে নিহত হবার পর [[নভেম্বর ৩|৩ নভেম্বর]], ১৯৭৫ সালে একটি সামরিক অভ্যুত্থানের নেতৃত্ব দেন। ঐ সময় তিনি সেনাপ্রধান মেজর জেনারেল [[জিয়াউর রহমান|জিয়াউর রহমানকে]] গৃহবন্দি করেন এবং নিজেকে মেজর জেনারেল পদে উন্নীত করে সেনাপ্রধান হন । ঠিক তিন দিন পর [[নভেম্বর ৭|৭ নভেম্বর]] আরেকটি পাল্টা অভ্যুত্থানে তিনি নিহত হন।
