আরএনএ সক্রিয়করণ (RNAa) হল একটি ছোট RNA-নির্দেশিত এবং Argonaute (Ago)-নির্ভর জিন নিয়ন্ত্রণের ঘটনা যেখানে প্রবর্তক-লক্ষ্যযুক্ত শর্ট ডাবল-স্ট্র্যান্ডেড RNAs (dsRNAs) ট্রান্সক্রিপশনাল/এপিজেনেটিক স্তরে টার্গেট জিনের অভিব্যক্তিকে ইনডিউস করে। RNAa সর্বপ্রথম ২০০৬ সালের একটি পিএনএএস পেপারে রিপোর্ট করা হয়েছিল Li et al। যিনি এই ধরনের জিন সক্রিয়করণের ঘটনাকে বর্ণনা করার জন্য RNA ইন্টারফারেন্স ( RNAi ) [১] বিপরীতে "RNAa" শব্দটি তৈরি করেছিলেন। dsRNA গুলি যেগুলি RNAa কে ট্রিগার করে তাকে ছোট সক্রিয় RNA ( saRNA ) বলা হয়। [২] মানব কোষে RNAa-এর প্রাথমিক আবিষ্কারের পর থেকে, অন্যান্য অনেকেই, মানব, অ-মানব প্রাইমেট, ইঁদুর এবং ছুচো সহ বিভিন্ন স্তন্যপায়ী প্রজাতি [৩][৪][৫][৬] উদ্ভিদ [৭] এবং C. elegans এ,[৮][৯] একই রকম পর্যবেক্ষণ করেছে, যা থেকে ধারনা করা যায় যে RNAa হল জিন নিয়ন্ত্রণের একটি বিবর্তনীয়ভাবে সংরক্ষিত প্রক্রিয়া।

RNAa কে সাধারণত দুটি শ্রেণীতে ভাগ করা যায়ঃ বহির্মুখী এবং অন্তঃর্মুখী। বহির্মুখী বা এক্সোজেনাস RNAa কৃত্রিমভাবে ডিজাইন করা saRNA দ্বারা ট্রিগার হয় যা জিন প্রোমোটার এর মতো নন-কোডিং সিকোয়েন্সগুলিকে টার্গেট করে [১] এবং একটি জিনের ৩'টি টার্মিনাস [১০] ও এই saRNAগুলিকে রাসায়নিকভাবে সংশ্লেষন করা যেতে পারে [১] বা ছোট হেয়ারপিন RNA (shRNA) হিসাবে প্রকাশ করা যেতে পারে। [৪] যেখানে অন্তঃর্মুখী বা এন্ডোজেনাস RNAa-এর ক্ষেত্রে, জিনের অভিব্যক্তির উন্নীতকরণ, স্তন্যপায়ী কোষে এবং সি. এলিগানস,[৯] এবং সি. এলিগানসে ২২জি আরএনএ [৮] miRNA-এর মতো প্রাকৃতিকভাবে সংঘটিত অন্তঃর্মুখী ছোট RNA দ্বারা পরিচালিত হয় [১১][১২]

পদ্ধতি সম্পাদনা

RNAa এর আণবিক প্রক্রিয়া সম্পূর্ণরূপে বোঝা যায় না। RNAi-এর মতোই, দেখা গেছে যে স্তন্যপায়ী RNAa-এর জন্য Argonaute প্রোটিনের Ago ক্লেডের সদস্য বিশেষ করে Ago2 প্রয়োজন,[১][১৩] যা RNAi থেকে স্বতন্ত্র গতিবিদ্যার অধিকারী হতে হবে। [১৪] RNAi-এর উল্টো দিকে, প্রোমোটার-টারগেটেড saRNAs এপিজেনেটিক পরিবর্তন সহ জিনের প্রকাশের দীর্ঘায়িত সক্রিয়করণকে প্রভাবিত করে॥ [১৫] বর্তমানে এটি মনে করা হয় যে saRNA গুলি প্রথমে একটি Ago প্রোটিন এর মাধ্যমে লোড এবং প্রসেস হয় একটি Ago-RNA কমপ্লেক্স গঠন করে যা পরে RNA দ্বারা তার প্রবর্তক লক্ষ্য (promoter target) -এ পরিচালিত হয়। লক্ষ্য বা টার্গেট একটি নন-কোডিং ট্রান্সক্রিপ্ট হতে পারে যা প্রবর্তক [৬][১৩] বা ক্রোমোসোমাল ডিএনএকে ওভারল্যাপ করে। [১৫][১৬] পরবর্তিতে আরএনএ-পূর্ণ অ্যাগো (Ago) আরএইচএ-যা নিউক্লিয়ার ডিএনএ হেলিকেস-২ নামেও পরিচিত এবং CTR9 এর মতো অন্যান্য প্রোটিন নিয়োগ করে, একটি RNA-প্ররোচিত ট্রান্সক্রিপশনাল অ্যাক্টিভেশন (RITA) কমপ্লেক্স গঠন করার জন্য। RITA সরাসরি RNAP II এর সাথে ক্রিয়া করতে পারে ট্রান্সক্রিপশন সূচনা এবং উৎপাদনশীল ট্রান্সক্রিপশন প্রসারণকে উদ্দীপিত করতে যা H2B এর বর্ধিত সর্বব্যাপীতার (ubiquitination) সাথে সম্পর্কিত। [১৭][১৮]

অন্তঃর্মুখী RNAa সম্পাদনা

২০০৮ সালে, Place et al. অনেকগুলো মানব জিনের প্রমোটারদের উপর miRNAএর লক্ষ্যগুলি (টার্গেট) miR-373 চিহ্নিত করেন এবং দেখা গেছে যে মানব কোষে miR-373 এর অনুকরণীয় উপস্হিতি পূর্বাভাসিত টার্গেট জিনের অভিব্যক্তিকে প্রভাবিত করে। এই গবেষণার মাধ্যমে প্রথম উদাহরণ পাওয়া যায় যে RNAa-কে প্রাকৃতিক ভাবে পাওয়া  নন-কোডিং RNA ( ncRNA ) মধ্যস্থতা করা যেতে পারে। ২০১১ সালে, Huang et al. ইদুরের কোষে গবেষনায় পান যে যে অন্তঃর্মুখী RNAa শারীরবৃত্তীয় প্রেক্ষাপটে miRNAs কার্যক্রম দ্বারা প্রভাবিত হয় এবং সম্ভবত ক্যান্সার কোষ তার বৃদ্ধি লাভের জন্য এই সুবিধার সুযোগ গ্রহণ করে। তারপর থেকে, জিন প্রবর্তক [১৯][২০][২১][২২] বা বর্ধক,[২৩] এর ফলে গুরুত্বপূর্ণ জৈবিক ভূমিকা পালন করে জিনের অভিব্যক্তিকে উন্নীত করার জন্য অনেকগুলি miRNA দেখানো হয়েছে। একটি ভাল উদাহরণ হল miR-551b-3p যা পরিবর্ধনের কারণে ডিম্বাশয়ের ক্যান্সারে অতিমাত্রায় প্রকাশ পায়। [২১] STAT3 এর প্রবর্তককে লক্ষ্য করে এর ট্রান্সক্রিপশন বাড়ানোর জন্য, miR-551b-3p ডিম্বাশয়ের ক্যান্সার কোষগুলিকে অ্যাপোপটোসিসের প্রতিরোধ এবং একটি প্রসারিত সুবিধা প্রদান করে। [২১]

সি. এলিগানস হাইপোডার্মাল সীম কোষে, লিন-4 miRNA-এর ট্রান্সক্রিপশন ইতিবাচকভাবে লিন-4 দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয় যা এর প্রোমোটারে একটি সংরক্ষিত লিন-4 পরিপূরক উপাদানের সাথে আবদ্ধ হয়, যা একটি ইতিবাচক অটোরেগুলেটরি লুপ গঠন করে। [৯][২৪]

C. elegans-এ, Argonaute CSR-1 RNA-নির্ভর RNA পলিমারেজ থেকে প্রাপ্ত 22G ছোট RNA এবং অ্যান্টিসেন্স থেকে জীবাণু-প্রকাশিত ট্রান্সক্রিপ্টের সাথে মিথস্ক্রিয়া করে এই mRNA গুলিকে Piwi থেকে রক্ষা করার জন্য - piRNA মধ্যস্থতা নীরবতা প্রচারের মাধ্যমে এপিজেনেটিক অ্যাক্টিভেশন। [২৫][২৬]

স্তন্যপায়ী কোষে অন্তঃসত্ত্বা RNAa দ্বারা জিন নিয়ন্ত্রণ কতটা ব্যাপক তা বর্তমানে অজানা। গবেষণায় দেখা গেছে যে উভয় miRNAs [২৭] এবং Ago প্রোটিন (Ago1) [২৮] মানব জিনোমের অসংখ্য সাইট, বিশেষ করে প্রবর্তক অঞ্চলে, জিন প্রতিলিপিতে ব্যাপকভাবে ইতিবাচক প্রভাব ফেলে।

অ্যাপ্লিকেশন সম্পাদনা

RNAa ভেক্টর-ভিত্তিক জিন ওভার এক্সপ্রেশনের পরিবর্তে জিন ফাংশন অধ্যয়ন করতে ব্যবহৃত হয়েছে। [২৯] গবেষণাগুলি ভিভোতে RNAa এবং ক্যান্সার এবং অ-ক্যান্সারজনিত রোগের চিকিৎসায় এর সম্ভাব্য থেরাপিউটিক অ্যাপ্লিকেশনগুলি প্রদর্শন করেছে। [৪]Chen R, Wang T, Rao K, Yang J, Zhang S, Wang S, Liu J, Ye Z (অক্টোবর ২০১১)। "Up-regulation of VEGF by small activator RNA in human corpus cavernosum smooth muscle cells": 2773–80। ডিওআই:10.1111/j.1743-6109.2011.02412.xপিএমআইডি 21819543 </ref>[৩০][৩১][৩২][৩৩][৩৪][৩৫]

২০১৬ সালের জুনে, ইউকে-ভিত্তিক MiNA থেরাপিউটিকস CEBPA জিন সক্রিয় করার প্রয়াসে, যকৃতের ক্যান্সারে আক্রান্ত রোগীদের মধ্যে প্রথম প্রথম saRNA ড্রাগ MTL-CEBPA-এর প্রথম ধাপের ট্রায়াল শুরু করার ঘোষণা দেয়। [৩৬][৩৭]

তথ্যসূত্র সম্পাদনা

  1. Li LC, Okino ST, Zhao H, Pookot D, Place RF, Urakami S, Enokida H, Dahiya R (নভেম্বর ২০০৬)। "Small dsRNAs induce transcriptional activation in human cells": 17337–42। ডিওআই:10.1073/pnas.0607015103 পিএমআইডি 17085592পিএমসি 1859931  [অ-প্রাথমিক উৎস প্রয়োজন]
  2. Li, Longcheng; Dahiya, Rajvir. "Small Activating RNA Molecules and Methods of Use." U.S. Patent US 8,877,721 filed October 1, 2004, and issued November 4, 2014.
  3. Janowski BA, Younger ST, Hardy DB, Ram R, Huffman KE, Corey DR (মার্চ ২০০৭)। "Activating gene expression in mammalian cells with promoter-targeted duplex RNAs": 166–73। ডিওআই:10.1038/nchembio860পিএমআইডি 17259978 
  4. Turunen MP, Lehtola T, Heinonen SE, Assefa GS, Korpisalo P, Girnary R, Glass CK, Väisänen S, Ylä-Herttuala S (সেপ্টেম্বর ২০০৯)। "Efficient regulation of VEGF expression by promoter-targeted lentiviral shRNAs based on epigenetic mechanism: a novel example of epigenetherapy": 604–9। ডিওআই:10.1161/CIRCRESAHA.109.200774 পিএমআইডি 19696410 
  5. Huang V, Qin Y, Wang J, Wang X, Place RF, Lin G, Lue TF, Li LC (জানুয়ারি ২০১০)। "RNAa is conserved in mammalian cells": e8848। ডিওআই:10.1371/journal.pone.0008848 পিএমআইডি 20107511পিএমসি 2809750  
  6. Matsui M, Sakurai F, Elbashir S, Foster DJ, Manoharan M, Corey DR (ডিসেম্বর ২০১০)। "Activation of LDL receptor expression by small RNAs complementary to a noncoding transcript that overlaps the LDLR promoter": 1344–55। ডিওআই:10.1016/j.chembiol.2010.10.009পিএমআইডি 21168770পিএমসি 3071588  
  7. Shibuya K, Fukushima S, Takatsuji H (ফেব্রুয়ারি ২০০৯)। "RNA-directed DNA methylation induces transcriptional activation in plants": 1660–5। ডিওআই:10.1073/pnas.0809294106 পিএমআইডি 19164525পিএমসি 2629447  
  8. Seth M, Shirayama M, Gu W, Ishidate T, Conte D, Mello CC (ডিসেম্বর ২০১৩)। "The C. elegans CSR-1 argonaute pathway counteracts epigenetic silencing to promote germline gene expression": 656–63। ডিওআই:10.1016/j.devcel.2013.11.014পিএমআইডি 24360782পিএমসি 3954781  
  9. Turner MJ, Jiao AL, Slack FJ (জানু ৭, ২০১৪)। "Autoregulation of lin-4 microRNA transcription by RNA activation (RNAa) in C. elegans": 772–81। ডিওআই:10.4161/cc.27679পিএমআইডি 24398561পিএমসি 3979913  
  10. Yue X, Schwartz JC, Chu Y, Younger ST, Gagnon KT, Elbashir S, Janowski BA, Corey DR (আগস্ট ২০১০)। "Transcriptional regulation by small RNAs at sequences downstream from 3' gene termini": 621–9। ডিওআই:10.1038/nchembio.400পিএমআইডি 20581822পিএমসি 3909968  
  11. Place RF, Li LC, Pookot D, Noonan EJ, Dahiya R (ফেব্রুয়ারি ২০০৮)। "MicroRNA-373 induces expression of genes with complementary promoter sequences": 1608–13। ডিওআই:10.1073/pnas.0707594105 পিএমআইডি 18227514পিএমসি 2234192  [অ-প্রাথমিক উৎস প্রয়োজন]
  12. Huang V, Place RF, Portnoy V, Wang J, Qi Z, Jia Z, Yu A, Shuman M, Yu J, Li LC (ফেব্রুয়ারি ২০১২)। "Upregulation of Cyclin B1 by miRNA and its implications in cancer": 1695–707। ডিওআই:10.1093/nar/gkr934পিএমআইডি 22053081পিএমসি 3287204  [অ-প্রাথমিক উৎস প্রয়োজন]
  13. Chu Y, Yue X, Younger ST, Janowski BA, Corey DR (নভেম্বর ২০১০)। "Involvement of argonaute proteins in gene silencing and activation by RNAs complementary to a non-coding transcript at the progesterone receptor promoter": 7736–48। ডিওআই:10.1093/nar/gkq648পিএমআইডি 20675357পিএমসি 2995069  
  14. Li, Long-Cheng (২০০৮)। "Small RNA-mediated gene activation"RNA and the Regulation of Gene Expression: A Hidden Layer of Complexity। Caister Academic Press। পৃষ্ঠা 189–99। আইএসবিএন 978-1-904455-25-7 
  15. Portnoy V, Huang V, Place RF, Li LC (২০১১)। "Small RNA and transcriptional upregulation": 748–60। ডিওআই:10.1002/wrna.90পিএমআইডি 21823233পিএমসি 3154074  
  16. Meng X, Jiang Q, Chang N, Wang X, Liu C, Xiong J, Cao H, Liang Z (মার্চ ২০১৬)। "Small activating RNA binds to the genomic target site in a seed-region-dependent manner": 2274–82। ডিওআই:10.1093/nar/gkw076পিএমআইডি 26873922পিএমসি 4797303  
  17. Portnoy V, Lin SH, Li KH, Burlingame A, Hu ZH, Li H, Li LC (মার্চ ২০১৬)। "saRNA-guided Ago2 targets the RITA complex to promoters to stimulate transcription": 320–35। ডিওআই:10.1038/cr.2016.22পিএমআইডি 26902284পিএমসি 4783471  
  18. Voutila J, Reebye V, Roberts TC, Protopapa P, Andrikakou P, Blakey DC, Habib R, Huber H, Saetrom P, Rossi JJ, Habib NA (ডিসেম্বর ২০১৭)। "Development and Mechanism of Small Activating RNA Targeting CEBPA, a Novel Therapeutic in Clinical Trials for Liver Cancer": 2705–2714। ডিওআই:10.1016/j.ymthe.2017.07.018পিএমআইডি 28882451পিএমসি 5768526  
  19. Matsui M, Chu Y, Zhang H, Gagnon KT, Shaikh S, Kuchimanchi S, Manoharan M, Corey DR, Janowski BA (ডিসেম্বর ২০১৩)। "Promoter RNA links transcriptional regulation of inflammatory pathway genes": 10086–109। ডিওআই:10.1093/nar/gkt777পিএমআইডি 23999091পিএমসি 3905862  
  20. Dharap A, Pokrzywa C, Murali S, Pandi G, Vemuganti R (২০১৩)। "MicroRNA miR-324-3p induces promoter-mediated expression of RelA gene": e79467। ডিওআই:10.1371/journal.pone.0079467 পিএমআইডি 24265774পিএমসি 3827167  
  21. Chaluvally-Raghavan P, Jeong KJ, Pradeep S, Silva AM, Yu S, Liu W, Moss T, Rodriguez-Aguayo C, Zhang D, Ram P, Liu J, Lu Y, Lopez-Berestein G, Calin GA, Sood AK, Mills GB (মে ২০১৬)। "Direct Upregulation of STAT3 by MicroRNA-551b-3p Deregulates Growth and Metastasis of Ovarian Cancer": 1493–1504। ডিওআই:10.1016/j.celrep.2016.04.034পিএমআইডি 27160903পিএমসি 4914391  
  22. Li S, Wang C, Yu X, Wu H, Hu J, Wang S, Ye Z (জানুয়ারি ২০১৭)। "miR-3619-5p inhibits prostate cancer cell growth by activating CDKN1A expression": 241–248। ডিওআই:10.3892/or.2016.5250 পিএমআইডি 27878260 
  23. Xiao M, Li J, Li W, Wang Y, Wu F, Xi Y, Zhang L, Ding C, Luo H, Li Y, Peng L, Zhao L, Peng S, Xiao Y, Dong S, Cao J, Yu W (অক্টোবর ২০১৭)। "MicroRNAs activate gene transcription epigenetically as an enhancer trigger": 1326–1334। ডিওআই:10.1080/15476286.2015.1112487পিএমআইডি 26853707পিএমসি 5711461  
  24. Vaschetto LM (এপ্রিল ২০১৮)। "miRNA activation is an endogenous gene expression pathway": 826–828। ডিওআই:10.1080/15476286.2018.1451722পিএমআইডি 29537927পিএমসি 6152443  
  25. Conine CC, Moresco JJ, Gu W, Shirayama M, Conte D, Yates JR, Mello CC (ডিসেম্বর ২০১৩)। "Argonautes promote male fertility and provide a paternal memory of germline gene expression in C. elegans": 1532–44। ডিওআই:10.1016/j.cell.2013.11.032পিএমআইডি 24360276পিএমসি 3924572  
  26. Wedeles CJ, Wu MZ, Claycomb JM (ডিসেম্বর ২০১৩)। "Protection of germline gene expression by the C. elegans Argonaute CSR-1": 664–71। ডিওআই:10.1016/j.devcel.2013.11.016 পিএমআইডি 24360783 
  27. Paugh SW, Coss DR, Bao J, Laudermilk LT, Grace CR, Ferreira AM, Waddell MB, Ridout G, Naeve D, Leuze M, LoCascio PF, Panetta JC, Wilkinson MR, Pui CH, Naeve CW, Uberbacher EC, Bonten EJ, Evans WE (ফেব্রুয়ারি ২০১৬)। "MicroRNAs Form Triplexes with Double Stranded DNA at Sequence-Specific Binding Sites; a Eukaryotic Mechanism via which microRNAs Could Directly Alter Gene Expression": e1004744। ডিওআই:10.1371/journal.pcbi.1004744 পিএমআইডি 26844769পিএমসি 4742280  
  28. Huang V, Zheng J, Qi Z, Wang J, Place RF, Yu J, Li H, Li LC (২০১৩)। "Ago1 Interacts with RNA polymerase II and binds to the promoters of actively transcribed genes in human cancer cells": e1003821। ডিওআই:10.1371/journal.pgen.1003821 পিএমআইডি 24086155পিএমসি 3784563  
  29. Wang J, Place RF, Huang V, Wang X, Noonan EJ, Magyar CE, Huang J, Li LC (ডিসেম্বর ২০১০)। "Prognostic value and function of KLF4 in prostate cancer: RNAa and vector-mediated overexpression identify KLF4 as an inhibitor of tumor cell growth and migration": 10182–91। ডিওআই:10.1158/0008-5472.CAN-10-2414পিএমআইডি 21159640পিএমসি 3076047  
  30. Kang MR, Yang G, Place RF, Charisse K, Epstein-Barash H, Manoharan M, Li LC (অক্টোবর ২০১২)। "Intravesical delivery of small activating RNA formulated into lipid nanoparticles inhibits orthotopic bladder tumor growth": 5069–79। ডিওআই:10.1158/0008-5472.can-12-1871 পিএমআইডি 22869584 
  31. Place RF, Wang J, Noonan EJ, Meyers R, Manoharan M, Charisse K, Duncan R, Huang V, Wang X, Li LC (মার্চ ২০১২)। "Formulation of Small Activating RNA Into Lipidoid Nanoparticles Inhibits Xenograft Prostate Tumor Growth by Inducing p21 Expression": e15। ডিওআই:10.1038/mtna.2012.5পিএমআইডি 23343884পিএমসি 3381590  
  32. Yoon S, Huang KW, Reebye V, Mintz P, Tien YW, Lai HS, Sætrom P, Reccia I, Swiderski P, Armstrong B, Jozwiak A, Spalding D, Jiao L, Habib N, Rossi JJ (জুন ২০১৬)। "Targeted Delivery of C/EBPα -saRNA by Pancreatic Ductal Adenocarcinoma-specific RNA Aptamers Inhibits Tumor Growth In Vivo": 1106–1116। ডিওআই:10.1038/mt.2016.60পিএমআইডি 26983359পিএমসি 4923325  
  33. Huan H, Wen X, Chen X, Wu L, Liu W, Habib NA, Bie P, Xia F (২০১৬-০১-০১)। "C/EBPα Short-Activating RNA Suppresses Metastasis of Hepatocellular Carcinoma through Inhibiting EGFR/β-Catenin Signaling Mediated EMT": e0153117। ডিওআই:10.1371/journal.pone.0153117 পিএমআইডি 27050434পিএমসি 4822802  
  34. Li C, Jiang W, Hu Q, Li LC, Dong L, Chen R, Zhang Y, Tang Y, Thrasher JB, Liu CB, Li B (এপ্রিল ২০১৬)। "Enhancing DPYSL3 gene expression via a promoter-targeted small activating RNA approach suppresses cancer cell motility and metastasis": 22893–910। ডিওআই:10.18632/oncotarget.8290পিএমআইডি 27014974পিএমসি 5008410  
  35. Reebye V, Huang KW, Lin V, Jarvis S, Cutilas P, Dorman S, Ciriello S, Andrikakou P, Voutila J, Saetrom P, Mintz PJ, Reccia I, Rossi JJ, Huber H, Habib R, Kostomitsopoulos N, Blakey DC, Habib NA (জুন ২০১৮)। "Gene activation of CEBPA using saRNA: preclinical studies of the first in human saRNA drug candidate for liver cancer": 3216–3228। ডিওআই:10.1038/s41388-018-0126-2পিএমআইডি 29511346পিএমসি 6013054  
  36. "MiNA Therapeutics Announces Initiation of Phase I Clinical Study of MTL-CEBPA in Patients with Liver Cancer | Business Wire"www.businesswire.com। ২ জুন ২০১৬। সংগ্রহের তারিখ ২০১৬-০৬-০৬ 
  37. "First-in-Human Safety and Tolerability Study of MTL-CEBPA in Patients With Advanced Liver Cancer - Full Text View - ClinicalTrials.gov"clinicaltrials.gov। সংগ্রহের তারিখ ২০১৬-০৬-০৬ 

আরও পড়া সম্পাদনা

 

বহিঃসংযোগ সম্পাদনা