[[মাদ্রাসা-ই-আলিয়া, কলকাতা|কলকাতা মাদ্রাসার]] প্রথম ২৬ জন অধ্যক্ষ ইউরোপিয়ান খ্রিষ্টান ছিলেন এবং পরবর্তী ৫ জন অধ্যক্ষ মুসলিম ছিলেন। ([[মাদ্রাসা-ই-আলিয়া, কলকাতার অধ্যক্ষের তালিকা|তালিকা দেখুন]]) পরে [[ভারত বিভাজন|১৯৪৭ সালে ভারত বিভাজন]] হলে গেলে মাদ্রাসাটির প্রায় সমস্ত বই-পুস্তক, শিক্ষক ঢাকাতে [[সরকারি মাদ্রাসা-ই-আলিয়া, ঢাকা|ঢাকা আলিয়া মাদ্রাসা]] হিসাবে স্থানান্তরিত হয়। এবং এই মাদ্রাসা যেহেতু কলকাতা মাদ্রাসাই ছিলো, তাই অধ্যক্ষের ক্রম শুরু হয় [[খান বাহাদুর জিয়াউল হক|৩১ তম]] থেকে।
প্রথম ২৬ জন ছিলেন ইউরোপিয়ান খ্রিষ্টান অধ্যক্ষ। ৩০ জন অধ্যক্ষ দায়িত্ব পালন করার পর কলকাতা আলিয়া মাদ্রাসা ঢাকায় স্থানান্তরিত হয়, এবং '''ঢাকা আলিয়া মাদ্রাসা''' নামে পরিচালিত হতে থাকে।
=== কলকাতা আলিয়া মাদ্রাসা হিসাবে অধ্যক্ষ ===
কলকাতা আলিয়া মাদ্রাসা হিসাবে ২৬ জন অধ্যক্ষ এই প্রতিষ্ঠানের প্রধান ছিলেন। তাদের তালিকা:
{| class="wikitable"
|+
!নং
!নাম
!দায়িত্ব শুরু
!দায়িত্ব শেষ
!চিত্র
|-
|০১
|[[এলায়স স্প্রেংগার]]
|১৮৫০
|১৮৭০
|
|-
|০২
|স্যার উইলিয়াম নাসনলীজ
|১৮৭০
|১৮৭০
|
|-
|০৩
|জে স্যাটক্লিফ (এম, এ)
|১৮৭০
|১৮৭৩
|
|-
|০৪
|এফ ব্রকম্যান (এম, এ)
|১৮৭৩
|১৮৭৮
|
|-
|০৫
|এ ই গাফ (এম, এ)
|১৮৭৮
|১৮৮১
|
|-
|০৬
|এ এফ আর হোর্নেল (সি, আই, ই) ( পি, এইচ, ডি)
|১৮৮১
|১৮৯০
|
|-
|০৭
|এইচ প্রথেরো (এম, এ)
|১৮৯০
|১৮৯০
|
|-
|০৮
|এ এফ হোর্নেল
|১৮৯০
|১৮৯২
|
|-
|০৯
|এ জে রো - (এম, এ)
|১৮৯২
|১৮৯২
|
|-
|১০
|এ এফ হোর্নেল
|১৮৯২
|১৮৯৫
|
|-
|১১
|এফ জে রো
|১৮৯৫
|১৮৯৭
|
|-
|১২
|এ এফ হোর্নেল
|১৮৯৭
|১৮৯৮
|
|-
|১৩
|এফ জে রো
|১৮৯৮
|১৮৯৯
|
|-
|১৪
|এফ সি হল
|১৮৯৯
|১৮৯৯
|
|-
|১৫
|স্যার অর্যাল স্টেইন
|১৮৯৯
|১৯০০
|
|-
|১৬
|এইচ এ স্টার্ক
|১৯০০
|১৯০০
|
|-
|১৭
|কর্ণেল রেস্কিং
|১৯০০
|১৯০১
|
|-
|১৮
|এইচ এ স্টার্ক
|১৯০১
|১৯০৩
|
|-
|১৯
|এডওয়ার্ড ভেনিসন
|১৯০৩
|১৯০৩
|
|-
|২০
|এইচ ই স্টেপেল্টন
|১৯০৩
|১৯০৪
|
|-
|২১
|ডেনিসন রাস
|১৯০৪
|১৯০৭
|
|-
|২২
|মিঃ চিফম্যান
|১৯০৭
|১৯০৮
|
|-
|২৩
|এডওয়ার্ড ডেনিসন
|১৯০৮
|১৯১১
|
|-
|২৪
|এ এইচ হারলি
|১৯১১
|১৯২৩
|
|-
|২৫
|জে এম বুটামলি
|১৯২৩
|১৯২৫
|
|-
|২৬
|এ এইচ হারলি
|১৯২৫
|১৯২৭
|
|-
|২৭
|[[খাজা কামালউদ্দীন আহমদ]] ('''প্রথম মুসলিম অধ্যক্ষ''')
|১৯২৭
|১৯২৮
|
|-
|২৮
|খান বাহাদুর মোহাম্মদ হেদায়াত হোসাইন
|১৯২৮
|১৯৩৪
|
|-
|২৯
|খান বাহাদুর মোহাম্মদ মুসা
|১৯৩৪
|১৯৪১
|
|-
|৩০
|মোহাম্মদ ইউসুফ
|১৯৪২
|১৯৪৩
|
|-
|৩১
|[[খান বাহাদুর জিয়াউল হক]] (১৯৪৩- ১৯৫৪) (মাদ্রাসা ঢাকায় স্থানান্তর)
