শ্বাসকষ্ট ও শারীরিক দূর্বলতা জনিতদুর্বলতাজনিত কারণে ২০১৯ সালের নভেম্বরের শেষের দিকে ঢাকার অ্যাপোলো হাসপাতালে ভর্তি হন। ব্রেন টিউমারে আক্রান্ত অবস্থায় ওই বছরের ২০ ডিসেম্বর শুক্রবার রাত ৮ টা ২৮ মিনিটে ঢাকার [[অ্যাপোলো হাসপাতাল ঢাকা|অ্যাপোলো হাসপাতালে]] মৃত্যুবরণ করেন।<ref>{{ওয়েব উদ্ধৃতি|ইউআরএল=https://www.jugantor.com/national/257719/স্যার-ফজলে-হাসান-আবেদ-আর-নেই|শিরোনাম=ব্র্যাকের প্রতিষ্ঠাতা ফজলে হাসান আবেদ আর নেই|ওয়েবসাইট=Jugantor|সংগ্রহের-তারিখ=2019-12-20}}</ref><ref>{{ওয়েব উদ্ধৃতি|ইউআরএল=https://www.ittefaq.com.bd/national/115967/স্যার-আবেদকে-সর্বস্তরের-মানুষের-শ্রদ্ধা|শিরোনাম=স্যার আবেদকে সর্বস্তরের মানুষের শ্রদ্ধা {{!}} জাতীয়|ওয়েবসাইট=ittefaq|সংগ্রহের-তারিখ=2019-12-23}}</ref>