মুফতি আমিনীআমিনীর রহ.বিরুদ্ধে কুরআনেরধর্মীয় পক্ষেরাজনীতির কথানামে বলারউষ্কানীমূলক কারণেরাজনীতির আওয়ামিলীগঅভিযোগ উঠায় সরকারের পক্ষ থেকে আমৃত্যু প্রায় দেড় বছর যাবৎ তাঁকে লালবাগ মাদ্রাসা সংলগ্ন দলীয় কার্যালয়ের মধ্যে অঘোষিত গৃহবন্দী ছিলেন। ২০১১ সালের ১০ এপ্রিল মুফতি আমিনীর ছোট ছেলে মাওলানা আবুল হাসনাত অপহরণের পর ১২ এপ্রিল জোটের মহাসচিব মাওলানা আবদুল লতিফ নেজামী মুফতি আমিনীর পক্ষে নিরাপত্তা চেয়ে তৎকালীন স্বরাষ্ট্রমন্ত্রীর কাছে আবেদন করলে আমিনীর নিরাপত্তার আবেদন কৌশল হিসেবে নিয়ে তাকে কার্যত বন্দী করে রাখা হয়। প্রায় ১৩ মাস গৃহবন্দী থাকার পর শুধু ১৫ মে ২০১২ পটিয়া মাদ্রাসার বিশিষ্ট আলেম শাহ মোহাম্মদ আইয়ুবের জানাজায় অংশ নিতে পুলিশ প্রহরায় চট্টগ্রাম যান এবং জানাযা শেষে ঐ দিনই ঢাকা প্রত্যাবর্তন করেন।<ref name="radioTehran"/>