বিশ জন বিদেশী নাগরিক, ছয় জন বন্দুকধারী এবং দুই জন পুলিশ কর্মকর্তা ঘটনার রাতেই নিহত হন। তাদেরকেবিদেশীদের ধারালো অস্ত্র দিয়ে হত্যা করা হয়। যেখানে আরও পঞ্চাশ জন, যাদের বেশিরভাগ পুলিশ সদস্য,<ref name=বাংলা-প্রতিদিন>{{ওয়েব উদ্ধৃতি|title=সন্ত্রাসী হামলায় ওসি সালাহ উদ্দীন নিহত|url=http://www.bd-pratidin.com/national/2016/07/02/154809|website=বাংলাদেশ প্রতিদিন|accessdate=২ জুলাই ২০১৬}}</ref> আহত হন।<ref name="IANS"/><ref name="ispr_brief">{{cite web|url=http://www.thedailystar.net/city/gulshan-attack-ispr-briefing-1230pm-1249231|title=Dhaka attack: 20 hostages killed Friday night, says ISPR|work=The Daily Star|date=2 July 2016}}</ref> নিহতদের মধ্যে দুই জন পুলিশ কর্মকর্তা ছিলেন, যাদের একজন [[ ঢাকা মেট্রোপলিটন পুলিশ]] গোয়েন্দা বিভাগের [[Assistant commissioner#Bangladesh|সহকারী কমিশনার]], এবং অন্যজন বনানী থানার ভারপ্রাপ্ত কর্মকর্তা।<ref name="bdnews24-1">{{cite web|url=http://bdnews24.com/bangladesh/2016/07/02/police-officer-killed-as-gunmen-attack-bangladesh-restaurant|title=Police officer killed as gunmen attack Bangladesh restaurant|work=BDNews24|date=2 July 2016}}</ref><ref name="people">{{cite web|url=http://www.people.com/article/bangladesh-hostage-situation-local-cafe-bakery|title=2 Officers Dead, Dozens Wounded in Ongoing Bangladeshi Hostage Situation: Reports|work=People Magazine|date=1 July 2016}}</ref><ref>{{cite web|url=http://www.prothom-alo.com/bangladesh/article/905997/রেস্তোরাঁ-থেকে-২০-মৃতদেহ-উদ্ধার-আইএসপিআর|title=রেস্তোরাঁ থেকে ২০ মৃতদেহ উদ্ধার: আইএসপিআর|date=2 July 2016|work=প্রথম আলো|accessdate=2 July 2016}}</ref> নিহতদের মধ্যে জাপানি ও ইতালীয় নাগরিক ছিল।<ref name="rt" /> ১৯ বছর বয়সী এক ভারতীয় নাগরিকও নিহত হয়।<ref>{{cite news|title=Dhaka attack: 19-year-old Indian girl among 20 hostages killed, PM Modi phones Sheikh Hasina|url=http://zeenews.india.com/live-updates/hostage-situation-in-dhaka-after-gunmen-attack-restaurant-in-diplomatic-quarter-1902480|accessdate=2 July 2016|work=Zee News|date=2 July 2016}}</ref> বাংলাদেশ সেনাবাহিনী প্রাথমিকভাবে ঘোষণা করে যে নিহতদের সকলে বিদেশী ছিল, এবং তারা অপরাধীরা যাদের "ধারালো অস্ত্র দ্বারা নির্মমভাবে হত্যা করেছিল"।<ref name="ispr_brief"/> এদের মধ্যে যারা [[কুরআন]] থেকে একটি আয়াত বলতে পেরেছিল শুধুমাত্র সেসকল [[কাফির|অ-মুসলিমরা]] রক্ষা পেয়েছিল।<ref>{{cite web|url=http://www.thedailystar.net/city/those-who-cited-quran-verse-were-spared-1249228|title=‘Those who could cite Quran were spared’|date=2 July 2016|publisher=The Daily Star}}</ref><ref>{{cite web|url=http://www.telegraph.co.uk/news/2016/07/01/gunmen-attack-restaurant-in-diplomatic-quarter-of-bangladeshi-ca/|title=20 hostages killed in 'Isil' attack on Dhaka restaurant popular with foreigners|publisher=The Daily Telegraph|accessdate=2 July 2016}}</ref>
নিহতদের মধ্যে সাত জন জাপানি নাগরিক ছিল – পাঁচ জন পুরুষ এবং দুই জন নারী – যাদের [[জাপান ইন্টারন্যাশনাল কোঅপারেশন এজেন্সি|জাপান ইন্টারন্যাশনাল কোঅপারেশন এজেন্সির]] সাথে যুক্ত করা হয়েছে।<ref name="japanese">{{cite news|url=http://www3.nhk.or.jp/news/html/20160702/k10010581321000.html|title=「日本人７人死亡確認」 バングラデシュ人質事件|trans-title='Seven Japanese Deaths Confirmed' Bangladesh Hostage Incident|publisher=NHK|language=Japanese|date=2 July 2016|accessdate=2 July 2016}}</ref> পরবর্তীতে অপারেশন থান্ডারবোল্টের সময় ছয় সন্ত্রাসী নিহত হয় এবং সন্দেহভাজন একজন সন্ত্রাসীকে আটক করা হয়। এছাড়া এই অভিযানে জিম্মিদশা থেকে তিন বিদেশিসহ ১৩ জনকে মুক্ত করা হয়।<ref>{{ওয়েব উদ্ধৃতি|url=http://www.prothom-alo.com/bangladesh/article/905997/রেস্তোরাঁ-থেকে-২০-মৃতদেহ-উদ্ধার-আইএসপিআর|title=রেস্তোরাঁ থেকে ২০ মৃতদেহ উদ্ধার: আইএসপিআর|publisher=প্রথম আলো|accessdate=২ জুলাই ২০১৬}}</ref>
