নলহাটি শহরটি {{Coord|24.3|N|87.82|E|}} অক্ষ দ্রাঘিমাংশে অবস্থিত।refঅবস্থিত।<ref>{{cite web|url=http://www.fallingrain.com/world/IN/28/Nalhati.html |title=Falling Rain Genomics, Inc - Nalhati |publisher=Fallingrain.com |date= |accessdate=2012-06-16}}</ref> শহরটি সমুদ্রপৃষ্ঠ থেকে ৪৮ মিটার (১৬০ ফুট) উচ্চতায় অবস্থিত। এটি ছোটোনাগপুর মালভূমিতে অবস্থিত। শহরের মধ্যে একটি ক্ষুদ্রাকায় পাহাড়ের অংশও দেখা যায়। এই পাহাড়ের উপরে নলহাটেশ্বরী মন্দির ও আনা বাবা মামার শরিফ অবস্থিত। এই অঞ্চলে বীরভূমের মাটির রং [[বাঁকুড়া জেলা|বাঁকুড়া]] ও [[পুরুলিয়া জেলা|পুরুলিয়া জেলার]] মতো লাল। তাই এই অঞ্চলকে “লালমাটির দেশ” বলা হয়। নলহাটি শহরটি [[পানাগড়—মোরগ্রাম হাইওয়ে|পানাগড়—মোরগ্রাম হাইওয়ের]] উপর অবস্থিত।